Търговският регистър се води и поддържа от Агенцията по вписванията към Министъра на правосъдието (чл. 3, ал. 1 от ЗТР, чл. 1, ал. 2 от Наредба № 1). Той представлява единна централизирана електронна база данни, съдържаща вписаните обстоятелства по чл. 4 от ЗТР, обявените актове по чл. 5 от ЗТР, документите, въз основа на които са извършени вписванията, заличаванията и обявяванията, и запазените фирми по чл. 35 от ЗТР (чл. 3, ал. 1 от Наредба № 1).
Съгласно Закона за търговския регистър няма изискване регистрацията или вписването на промени в ООД (ЕООД) да бъде в териториалното звено на Агенцията към съответния окръжен съд, където е седалището на търговеца. Практически това дава възможност на едно лице да регистрира или впише промени в ООД (ЕООД) със седалище и адрес на управление в един град или друго населено място, като подаде заявление за вписване в търговския регистър в териториално звено на Агенцията по седалището на окръжен съд в друг град. Компетентен орган, който разглежда заявленията, е длъжностно лице по регистрацията към съответната териториална служба (чл. 19, ал. 1 от ЗТР).
Вписването се извършва при наличие на писмено заявяване от лице, легитимирано от закона. Легитимираните лица, които могат да заявяват вписване, са установени в чл. 15 от ЗТР. При ООД (ЕООД) лицата, които могат да искат вписване са: управителят, съответно управителите, ликвидатор, съдебен изпълнител, адвокат с изрично пълномощно, всяко заинтересовано лице или прокурор, които са предявили иск за установяване на нищожност или недопустимост на вписване, както и за несъществуване на вписано обстоятелство, когато искът е уважен (чл. 30, ал. 1 от ЗТР). Оправомощените лица са длъжни да поискат вписването в 7-дневен срок от възникване на обстоятелството, подлежащо на вписване (чл. 6, ал. 2 от ЗТР). Заявленията за вписване се подават в която и да е териториална служба по регистрация на Агенцията по седалището на окръжните съдилища (чл. 13, ал. 7 от ЗТР). Заявленията могат да се подават от изброените по-горе заявители или от пълномощник с изрично писмено пълномощно (чл. 15, ал. 2 от ЗТР). Регистърно задължените лица, които не изпълнят задължението си за вписване се наказват с глоба от 500 до 1000 лева (чл. 40, ал. 1 от ЗТР).
В търговския регистър се вписват всички последващи промени във вече вписани обстоятелства. Вписването на други обстоятелства е недопустимо. Такова вписване е нищожно и не поражда правни последици. За ООД/ЕООД обстоятелствата, подлежащи на вписване, са следните (чл. 119, ал. 2 от ТЗ):
а) промяна на фирмата, седалището или адреса на управление на дружеството.Промяната влиза в сила след вписването й в търговския регистър;
б) промяна на срока, за който дружеството е учредено или промяна в предмета на дейност на дружеството. Промяната влиза в сила след вписването й в търговския регистър;
в) промяна на съдружник. Вписват се името, постоянния адрес, респ. фирмата, седалището на новоприетия, освободен или изключен съдружник. Приемането и изключването на съдружник има действие от вписването му в ТР;
г) прехвърляне на дружествен дял на съдружник или на трето лице. Промяната влиза в сила след вписването й в ТР респ. и промяната в съдружниците - от вписването в ТР;
д) промяна в начина на управление и представляване на дружеството, както и промяната на лицето (лицата), представляващо дружеството. Избирането и освобождаването на управител има действие от вписването му в ТР;
е) промяна в размера на капитала на дружеството. Вписват се и решенията на общото събрание за увеличаване или намаляване на капитала. Те влизат в сила след вписването им в търговския регистър (чл. 140, ал. 3 от ТЗ). Не подлежи на вписване промяната в размера на дяловете на съдружниците, но измененият дружествен договор следва да се представи в Агенцията по вписванията и да се приложи към партидата, но се вписва решението на общото събрание за изменение или допълнение на дружествения договор (чл. 140, ал. 3 от ТЗ); Изменението на капитала има действие от вписването му в ТР (чл. 140, ал. 4 от ТЗ).
ж) преобразуване на дружеството. Преобразуването на дружеството се състои в промяна на вида на дружеството, сливане на две или повече дружества, вливане на едно дружество в друго, разделяне на две или повече други дружества.
з) прехвърляне на предприятие от дружеството;
и) залог на търговско предприятие;
й) залог на дружествен дял;
к) запор на дружествен дял;
л) прекратяване на дружеството.
м) обявяване на дружеството в несъстоятелност. Вписва се съдебното решение за откриване производство по несъстоятелност (чл. 630 от ТЗ). Вписването става служебно. Вписват се и името, адреса, постоянния и настоящ адрес и ЕГН на синдика;
н) заличаване на дружеството.
При промяна на дружествения договор, независимо от факта, че промените касаят обстоятелства, които не подлежат на вписване, в регистърния съд следва да се представи и приложи към партидата на дружеството изменения дружествен договор. На вписване подлежат решенията на общото събрание, с които се изменя или допълва дружествения договор. Те влизат в сила след вписването им в търговския регистър (чл. 140, ал. 3 от ТЗ).
Размерът на таксите за вписване на обстоятелства се определя с Тарифа за държавните такси, събирани от Агенцията по вписванията.